Сүрьеэгийн оношилгоо ба эмэнд тэсвэртэй байдлыг илрүүлэх шинэ зэвсэг: Сүрьеэгийн хэт мэдрэг байдлын оношлогооны машин сургалттай хослуулсан шинэ үеийн зорилтот дараалал (tNGS)
Уран зохиолын тайлан: CCa: tNGS болон машин сургалтанд суурилсан оношлогооны загвар нь бактерийн гаралтай сүрьеэ, сүрьеэгийн менингит багатай хүмүүст тохиромжтой.
Дипломын ажлын нэр: Сүрьеэгийн зорилтот дараагийн үеийн дараалал ба машин сургалт: уушигны уушигны гуурсан хоолой ба гуурсан менингитийг оношлох хэт мэдрэмтгий стратеги.
Тогтмол хэвлэл: 《Clinica Chimica Acta》
Хэрэв: 6.5
Хэвлэгдсэн огноо: 2024 оны 1-р сар
Хятадын Шинжлэх Ухааны Академийн Их Сургууль, Нийслэл Анагаах Ухааны Их Сургуулийн Бээжингийн цээжний эмнэлэгтэй хамтран Макро & Микро-Тест нь шинэ үеийн зорилтот дараалал (tNGS) технологи, машин сургалтын аргад суурилсан сүрьеэгийн оношилгооны загварыг бий болгосон нь хэт өндөр үр дүнд хүрсэн. нян багатай сүрьеэгийн мэдрэмтгий байдал, сүрьеэгийн менингитийг илрүүлэх, хоёр төрлийн сүрьеэгийн эмнэлзүйн оношлогоонд хэт мэдрэг байдлын шинэ аргыг гаргаж, сүрьеэ өвчнийг үнэн зөв оношлох, эмэнд тэсвэртэй байдлыг илрүүлэх, эмчлэхэд тус дөхөм болсон.Үүний зэрэгцээ өвчтөний цусны сийвэнгийн cfDNA-ийг TBM-ийн оношлогоонд эмнэлзүйн дээж авахад тохиромжтой дээж болгон ашиглаж болох нь тогтоогдсон.
Энэхүү судалгаанд сийвэнгийн 227 дээж, тархи нугасны шингэний дээжийг хоёр эмнэлзүйн бүлэг байгуулахад ашигласан бөгөөд үүнд лабораторийн оношлогооны когортын дээжийг сүрьеэгийн оношилгооны машин сургалтын загварыг бий болгоход ашигласан бөгөөд эмнэлзүйн оношлогооны когортын дээжийг тогтоосон эсэхийг шалгахад ашигласан болно. оношлогооны загвар.Бүх дээжийг эхлээд Mycobacterium tuberculosis-ийн тусгайлан зохион бүтээсэн баривчлах датчикийн санд чиглүүлсэн.Дараа нь TB-tNGS-ийн дарааллын өгөгдөл дээр үндэслэн шийдвэрийн модны загварыг ашиглан лабораторийн оношлогооны дарааллын сургалт, баталгаажуулалтын багц дээр 5 дахин хөндлөн баталгаажуулалт хийж, сийвэнгийн дээж, тархи нугасны шингэний дээжийн оношлогооны босго оноог авдаг.Хүлээн авсан босгыг илрүүлэхийн тулд клиник оношлогооны дарааллын хоёр тестийн багцад оруулж, суралцагчийн оношлогооны гүйцэтгэлийг ROC муруйгаар үнэлдэг.Эцэст нь сүрьеэгийн оношлогооны загварыг олж авсан.
Судалгааны дизайны схем 1-р зураг
Үр дүн: Энэхүү судалгаанд тодорхойлсон CSF ДНХ-ийн дээж (AUC = 0.974) болон сийвэнгийн cfDNA дээжийн (AUC = 0.908) тодорхой босго оноогоор 227 дээжээс CSF дээжийн мэдрэмж 97.01%, өвөрмөц байдал 95.65%, мөн сийвэнгийн дээжийн мэдрэмж, өвөрмөц байдал 82.61%, 86.36% байв.TBM-тэй өвчтөнүүдийн сийвэнгийн cfDNA болон тархи нугасны шингэний ДНХ-ийн 44 хос дээжийг шинжлэхэд энэхүү судалгааны оношлогооны стратеги нь сийвэнгийн cfDNA болон тархи нугасны шингэний ДНХ-ийн өндөр тууштай байдал 90.91% (40/44) бөгөөд мэдрэмж нь 95.45% байна. (42/44).Уушигны сүрьеэтэй хүүхдүүдэд энэ судалгааны оношлогооны стратеги нь ижил өвчтөнүүдийн ходоодны шүүсний дээжийг Xpert илрүүлэх үр дүнгээс (28.57% VS 15.38%) харьцуулахад сийвэнгийн дээжинд илүү мэдрэмтгий байдаг.
Зураг 2 Популяцийн дээжийн сүрьеэгийн оношлогооны загварт хийсэн шинжилгээний гүйцэтгэл
Зураг 3 Хосолсон дээжийн оношлогооны үр дүн
Дүгнэлт: Энэхүү судалгаагаар сүрьеэгийн хэт мэдрэг оношилгооны аргыг тогтоосон бөгөөд энэ нь олигобациляр сүрьеэтэй (сөрөг өсгөвөр) эмнэлзүйн өвчтөнүүдэд хамгийн өндөр мэдрэгчтэй оношлогооны арга хэрэгсэл болж чадна.Цусны сийвэнгийн cfDNA дээр үндэслэн хэт мэдрэмтгий сүрьеэ илрүүлэх нь сүрьеэгийн идэвхтэй өвчин, сүрьеэгийн менингитийг оношлоход тохиромжтой сорьцын төрөл байж болно (тархины сүрьеэгийн сэжигтэй өвчтөнүүдэд плазмын дээжийг тархи нугасны шингэнээс цуглуулахад хялбар байдаг).
Эх холбоос: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990?%3Dihub-ээр дамжуулан
Макро & Микро-Тест сүрьеэ илрүүлэх цуврал бүтээгдэхүүний товч танилцуулга
Сүрьеэтэй өвчтөнүүдийн түүврийн нөхцөл байдал, янз бүрийн хэрэгцээг харгалзан Macro & Micro-Test нь цэрний дээжийг шингэрүүлэх, Qualcomm номын сангийн бүтэц, дараалал, өгөгдөлд дүн шинжилгээ хийх NGS шийдлүүдийн иж бүрэн цогцоор хангадаг.Тус бүтээгдэхүүнд сүрьеэтэй өвчтөний түргэн оношилгоо, сүрьеэгийн эмэнд тэсвэртэй байдлыг илрүүлэх, сүрьеэгийн микобактер ба NTM-ийн төрөл, нян-сөрөг сүрьеэ, сүрьеэтэй хүмүүсийн хэт мэдрэг байдлын оношлогоо зэрэг багтана.
Сүрьеэ ба микобактерийг илрүүлэх цуврал иж бүрдэл:
| Барааны дугаар | Бүтээгдэхүүний нэр | бүтээгдэхүүний туршилтын агуулга | дээжийн төрөл | холбогдох загвар |
| HWTS-3012 | Дээж гаргах агент | Цэрний дээжийг шингэрүүлэх эмчилгээнд ашигладаг бөгөөд Sutong Machinery Equipment 20230047 дугаартай нэгдүгээр зэрэглэлийн рекордыг авсан. | цэр | |
| HWTS-NGS-P00021 | Хэт мэдрэмтгий сүрьеэгийн Qualcomm тоо хэмжээг илрүүлэх хэрэгсэл (зонд барих арга) | Бактери-сөрөг уушигны сүрьеэ, тархины зангилааны хэт мэдрэг байдлыг инвазив бус (шингэн биопси) илрүүлэх;Сүрьеэгийн болон сүрьеэгийн бус микобактерийн халдвар авсан гэж сэжиглэгдсэн хүмүүсийн дээжийг өндөр гүн дарааллын метагеномикийн аргаар шинжилж, сүрьеэ ба сүрьеэгийн бус микобактерийн халдвар авсан эсэхийг илрүүлэх мэдээлэл, сүрьеэгийн микобактерийн эмэнд тэсвэртэй байдлын үндсэн мэдээлэл хангагдсан. | Захын цус, цулцангийн угаагч шингэн, гидроторакс ба асцит, фокусын хатгалт, тархи нугасны шингэн. | Хоёр дахь үе |
| HWTS-NGS-T001 | Микобактерийн төрөл ба эмэнд тэсвэртэй байдлыг илрүүлэх хэрэгсэл (олон талт олшруулалтын дарааллын арга) | MTBC болон 187 NTM зэрэг микобактерийг бичих тест；Mycobacterium tuberculosis-ийн эмэнд тэсвэртэй байдлыг илрүүлэхэд 13 эм, эмэнд тэсвэртэй генийн 16 үндсэн мутацийн голомтыг хамардаг. | Цэр, цулцангийн угаагч шингэн, усан торакс ба асцит, фокусын хатгалт, тархи нугасны шингэн. | Хоёр/гурав дахь үеийн хос платформ |
Онцлох зүйл: HWTS-NGS-T001 Микобактерийн бичилт ба эмэнд тэсвэртэй байдлыг илрүүлэх хэрэгсэл (олон талт олшруулах арга)
Бүтээгдэхүүний танилцуулга
Энэхүү бүтээгдэхүүн нь ДЭМБ-ын сүрьеэгийн эмчилгээний зааварт дурдсан үндсэн эхний болон хоёрдугаар эгнээний эмүүд, NTM эмчилгээний зааварт түгээмэл хэрэглэгддэг макролидууд болон аминогликозидууд дээр суурилдаг бөгөөд эмэнд дасалтай газрууд нь эмэнд дасалтай холбоотой бүх нэг бүлгийн бүх хэсгийг хамардаг. ДЭМБ-аас Mycobacterium tuberculosis цогцолбор мутацийн каталог, түүнчлэн дотоод болон гадаадад өндөр оноо авсан ном зохиолын судалгаа, статистикийн дагуу эмэнд тэсвэртэй ген, мутацийн бусад байршлыг мэдээлсэн.
Бичигчийг тодорхойлох нь Хятадын сүрьеэ, амьсгалын замын өвчний сэтгүүлээс нийтэлсэн NTM-ийн удирдамжид нэгтгэсэн NTM омог болон мэргэжилтнүүдийн зөвшилцөлд үндэслэсэн болно.Зохион бүтээгдсэн бичих праймерууд нь 190 гаруй төрлийн NTM-ийг өсгөж, дараалуулж, тэмдэглэж болно.
Зорилтот мультиплекс ПГУ-ын олшруулалтын технологийн тусламжтайгаар микобактерийн генотипийн ген, эмэнд тэсвэртэй генийг мультиплекс ПГУ-аар олшруулж, илрүүлэх зорилтот генийн ампликоны хослолыг олж авсан.Олшруулсан бүтээгдэхүүнийг хоёр дахь эсвэл гурав дахь үеийн өндөр хүчин чадалтай дарааллын сангууд болгон бүтээж болох ба бүх хоёр дахь болон гурав дахь үеийн дарааллын платформууд нь зорилтот генүүдийн дарааллын мэдээллийг олж авахын тулд өндөр гүн дараалалд хамрагдах боломжтой.Баригдсан лавлагааны мэдээллийн санд (ДЭМБ-ын микобактерийн сүрьеэгийн цогц мутацын каталог ба түүний эмэнд дасалтай хамаарал) агуулагдсан мэдэгдэж буй мутацитай харьцуулж эмэнд тэсвэртэй эсвэл сүрьеэгийн эсрэг эмийн мэдрэмтгий байдалтай холбоотой мутацуудыг тодорхойлсон.Цэрний дээжийг өөрөө нээдэг Macro & Micro-Test-ийн уусмалтай хослуулан эмнэлзүйн цэрний дээжийн нуклейн хүчлийг олшруулах үр ашиг багатай (уламжлалт аргуудаас арав дахин их) асуудлыг шийдэж, эмэнд тэсвэртэй байдлын дарааллыг илрүүлэх боломжтой болсон. эмнэлзүйн цэрний дээжинд шууд хэрэглэнэ.
Бүтээгдэхүүнийг илрүүлэх хүрээ
34эмийн дасалтай холбоотой генүүд18сүрьеэгийн эсрэг эм болон6NTM эм илрүүлсэн, хамарсан297эмэнд тэсвэртэй газар;Арав төрлийн сүрьеэгийн микобактер ба түүнээс дээш190төрлийн NTM илрүүлсэн.
Хүснэгт 1: 18+6 эмийн мэдээлэл +190+НТМ
Бүтээгдэхүүний давуу тал
Эмнэлзүйн дасан зохицох чадвар: Цэрний дээжийг өсгөвөргүйгээр өөрөө шингэрүүлэгч бодисоор шууд илрүүлэх боломжтой.
Туршилтын ажиллагаа нь энгийн: олшруулалтын эхний ээлж нь энгийн бөгөөд номын сангийн барилгын ажил 3 цагийн дотор дуусч, ажлын үр ашгийг дээшлүүлдэг.
Цогц шивэх, эмэнд тэсвэртэй байдал: Эмнэлзүйн анхаарах гол цэгүүд болох MTB болон NTM-ийн эмэнд дасалтай газар нутгийг хамрах, үнэн зөв бичих, эмэнд тэсвэртэй байдлыг илрүүлэх, бие даасан шинжилгээний програм хангамжийг дэмжих, нэг товшилтоор шинжилгээний тайланг гаргах.
Тохиромжтой байдал: бүтээгдэхүүний нийцтэй байдал, ILM болон MGI/ONT платформд дасан зохицох.
Бүтээгдэхүүний үзүүлэлт
| Бүтээгдэхүүний код | Бүтээгдэхүүний нэр | Илрүүлэх платформ | техникийн үзүүлэлтүүд |
| HWTS-NGS-T001 | Микобактерийн төрөл ба эмэнд тэсвэртэй байдлыг илрүүлэх хэрэгсэл (олон талт олшруулах арга) | ONT, Illumina, MGI, Salus pro | 16/96rxn |
Шуудангийн цаг: 2024 оны 1-р сарын 23-ны хооронд