Уран зохиол хуваалцах: Баруун Африкийн зэрлэг жижиг хөхтөн амьтдын вирусын профайлыг судлах нь шинэ вирус болон зоонозын эрсдлийг илрүүлж байна

Саяхан нийтлэгдсэн судалгааМикробиомБаруун Африкийн Сьерра-Леоноос цуглуулсан сарьсан багваахай, мэрэгч амьтан, мөөг зэрэг 846 зэрлэг жижиг хөхтөн амьтан дээр вирусын метагеномик шинжилгээ хийсэн. Судалгаагаар нийт 39 хөхтөн амьтантай холбоотой РНХ вирусыг илрүүлсэн бөгөөд үүнд 26 шинэ вирус, өмнө нь мэдэгдэж байсан 13 вирус багтсан. Эдгээрээс Paramyxoviridae овог хамгийн олон янз байдлыг харуулсан бол мэрэгч амьтад хамгийн олон тооны вирусын төрөл зүйлийг агуулдаг (n = 26).

Зоонозын эрсдэлийн үнэлгээгээр мэдэгдэж буй гурван зоонозын вирус болох энцефаломиокардит вирус, Ласса вирус, Рокахепевирусын төрөл зүйлийн вирус, мөн тархах эрсдэлтэй гурван вирус болох Мелиан вирус, мэрэгч амьтдын гепатит вирус, Хуннивирус А илэрсэн. Шинээр тодорхойлогдсон вирусуудын дундаас Бат ледантевирус 2 нь хүнд халдварладаг Ле Дантек вирустай хамгийн ойр филогенетикийн холбоо хамаарал үзүүлсэн нь анхаарал татаж байна. Серологийн шинжилгээгээр орон нутгийн оршин суугчдын 2.8%-д энэ вирусын эсрэг саармагжуулах эсрэгбие илэрсэн нь өмнө нь хүмүүст халдварлагдаж байсан, магадгүй илрээгүй байж болзошгүйг харуулж байна.

Эдгээр олдворууд нь Баруун Африкт мэрэгч амьтад зонхилсон вирусын томоохон нөөц байгааг онцолж байгаа бөгөөд хүн-амьтны хоорондох нэгдсэн хяналтын стратегийн чухал ач холбогдлыг онцолж байна. Метагеномик скринингийг серологийн баталгаажуулалттай хослуулснаар зооноз болон тархах магадлалтай вирусыг тодорхойлох найдвартай хүрээг бий болгодог.
шинэ вирус болон зооноз өвчний эрсдлийг илчилдэг

Сүүлийн арван жилд хүний ​​дунд шинээр гарч ирж буй халдварт өвчний 60 гаруй хувь нь амьтдын нөөцөөс үүдэлтэй бөгөөд сарьсан багваахай, мэрэгч амьтад, шумуул зэрэг нь зоонозын вирусын гол тээгч гэж тооцогддог. Африк тивийг зоонозын өвчний халуун цэг гэж өргөнөөр үздэг. Жишээлбэл, Сьерра-Леон улсад 2014-2016 оны Эбола вирусын дэгдэлтийн үеэр 28,000 гаруй тохиолдол бүртгэгдсэн байна.

Энэ бүс нутагт зоонозын өвчний ачаалал их байгаа хэдий ч зэрлэг жижиг хөхтөн амьтдын вирусын олон янз байдал, тархалтыг хангалттай тодорхойлоогүй хэвээр байна. Энэхүү зөрүүг арилгахын тулд судлаачид 2018-2023 оны хооронд Сьерра-Леон дахь гурван газарт баригдсан 846 зэрлэг жижиг хөхтөн амьтдын вирусын системчилсэн шинжилгээг хийсэн. Судалгааны зорилго нь вирусын олон янз байдлыг тодорхойлох, төрөл зүйл хоорондын халдвар дамжих боломжтой нэр дэвшигчдийг тодорхойлох, зоонозын эрсдлийг үнэлэх, шинээр гарч ирж буй халдварт өвчний эрт үеийн сэрэмжлүүлгийн системийг дэмжих нотолгоог бий болгох явдал байв.
Дараалал ба угсралт

Гол аргууд

Судалгаанд вирусын метагеномикийн цогц ажлын урсгалыг ашигласан:

  • Дээж боловсруулах:Зүрх, элэг, дэлүү, уушиг, бөөрний эдийг цуглуулж, нэгтгэж, нэгэн төрлийн болгож, нийт РНХ-г гаргаж авсан.
  • Дараалал ба угсралт:Номын сан байгуулахаас өмнө рибосомын РНХ-ийн бууралтыг хийж, дараа нь Illumina NovaSeq 6000 платформ ашиглан өндөр хүчин чадалтай дарааллыг тогтоосон. Вирусын контигуудыг шинээр угсарсан.
  • Вирус таних:Вирусыг РНХ-аас хамааралтай РНХ полимераза (RdRp) генийн уялдаа холбоонд үндэслэн тодорхойлсон. Зөвхөн сээр нуруутан амьтадтай холбоотой вирусыг хадгалсан бөгөөд бактери, мөөгөнцөр болон ургамлын вирусыг хассан.
  • Биоинформатикийн шинжилгээ:Филогенетикийн сэргээн босголт, рекомбинацийн шинжилгээ, зүйл хоорондын дамжуулалтын сүлжээний загварчлал, зооноз өвчний эрсдэлийн үнэлгээг хийсэн.
  • Серологийн баталгаажуулалт:Бат ледантевирус 2-т зориулсан VSV дээр суурилсан псевдовирусын саармагжуулалтын шинжилгээг боловсруулсан. Хүний сийвэнгийн 2.8%-д саармагжуулах эсрэгбие илэрсэн нь зооноз халдвар дамжих магадлалтай гэсэн нотолгоо болж байна.
    Серологийн баталгаажуулалт

    СудалгааҮр дүн

    1. Вирусын нээлт ба олон янз байдал

    Энэхүү судалгаагаар Сьерра-Леоноос цуглуулсан мэрэгч амьтад, сарьсан багваахай, мөөг зэрэг 846 зэрлэг амьтдын транскриптомын дарааллын шинжилгээг хийсэн. РНХ-ээс хамааралтай РНХ полимераза (RdRp) генийн бүрэн дараалалд үндэслэн өмнө нь мэдэгдэж байсан 13 вирус, 26 шинэ вирусыг багтаасан нийт 39 хөхтөн амьтантай холбоотой РНХ вирусыг тодорхойлсон.

    Вирусын найрлагын хувьд Парамиксовиридэй овог нь гурван эзэн багийн дунд хамгийн өндөр олон янз байдлыг харуулсан бөгөөд дараа нь Астровиридэй болон Пикорнавиридэй орсон байна. Эзэмшигчийн тархалтын хувьд мэрэгч амьтад вирусын олон янз байдлыг хамгийн ихээр нэмэгдүүлж, нийт 26 төрлийн вирус агуулсан нь тус бүс нутагт вирусын олон янз байдлын нөөц болох чухал үүргийг харуулж байна.

    2. Зоонозын эрсдэл

    Зоонозын эрсдэлийн үнэлгээгээр мэдэгдэж буй гурван зоонозын вирусыг тодорхойлсон: энцефаломиокардит вирус, Ласса вирус, Рокахепевирусын төрөл зүйл. Үүнээс гадна, Мелиан вирус, мэрэгч амьтдын гепатит вирус, Хуннивирус А зэрэг гурван вирус нь халдвар дамжих эрсдэлтэй болохыг тогтоосон.

    Шинээр нээгдсэн 26 вирусын дотроос дөрөв нь филогенетик болон геномын шинж чанарт үндэслэн өндөр зоонозын чадавхитай гэж таамаглаж байсан. Бат ледантевирус 2 нь хүний ​​халдварладаг мэдэгдэж буй Ле Дантек вирустай хамгийн ойр филогенетикийн холбоог харуулсан нь анхаарал татаж байна.

    Дараагийн серологийн судалгаагаар орон нутгийн оршин суугчдын сийвэнгийн 2.8%-д Bat ledantevirus 2-ын эсрэг саармагжуулах эсрэгбие илэрсэн тул энэхүү олдворыг улам баталсан. Энэхүү үр дүн нь хүний ​​популяцид танигдаагүй эсвэл шинж тэмдэггүй халдвар аль хэдийн гарсан байж болзошгүйг харуулж байгаа бөгөөд энэ нь зоонозын халдварын болзошгүй боловч өмнө нь илрүүлэгдээгүй байгааг харуулж байна.

    3. Зүйл хоорондын дамжуулалтын динамик

    Зүйл хоорондын дамжуулалтын шинжилгээгээр мэрэгч амьтад нь вирусын хуваалцах сүлжээнд төв байр суурь эзэлдэг бөгөөд эзэн зүйлийн хооронд вирусын солилцоог хөнгөвчлөх гол зангилаа болж ажилладаг болохыг харуулсан. Нийт 15 вирус нь төрөл зүйл хоорондын дамжуулалттай болохыг тогтоосон.

    Хөндлөн дарааллын дамжуулалтын хэв маягийн цаашдын шинжилгээгээр вирус хуваалцах нь ижил ангилал зүйн дарааллын эзэн хооронд илүү олон удаа тохиолддог болохыг харуулсан бөгөөд энэ нь эзэнтэй холбоотой байдал нь дамжуулалтын динамикт чухал үүрэг гүйцэтгэдэг болохыг харуулж байна. Үүний эсрэгээр, сарьсан багваахайнууд хөндлөн дарааллын дамжуулалтын харьцангуй бага чадварыг харуулсан.

    Чухал зүйл бол зарим вирусуудад эзэн биетний тархалтын нотолгоо ажиглагдсан. Жишээлбэл, өмнө нь шумууланд өвөрмөц гэж тооцогддог байсан Мелиан вирусыг энэхүү судалгаанд мэрэгч амьтдаас илрүүлсэн нь эзэн биетний дасан зохицох чадвар өөрчлөгдөж, илүү өргөн тархах эрсдэл нэмэгдэж байгааг харуулж байна.

    Зүйл хоорондын дамжуулалтын динамик

    Дүгнэлт ба нийгмийн эрүүл мэндийн үр дагавар

    • Зэрлэг жижиг хөхтөн амьтдын өндөр виромын олон янз байдал:26 шинэ зүйл зэрэг 39 РНХ вирусыг нээсэн нь тус бүс нутагт вирусын томоохон нөөц байгааг илрүүлж, анх удаа зооноз халдварын өндөр чадавхитай шинэ вирусууд (жишээ нь, Бат ледантевирус 2)-ыг мэдээлж байна.
    • Мэрэгч амьтдыг тэргүүлэх хяналтын зорилт болгон ашиглах нь:Мэрэгч амьтад нь вирусын халдвар дамжих гол төв болж, вирусын олон янз байдлыг хамгийн өндөр түвшинд байлгадаг тул халдвар дамжих хамгийн том эрсдэлийг илэрхийлдэг.
    • Нэгдсэн хяналтын стратегийн хэрэгцээ:Энэхүү олдворууд нь идэвхтэй хяналтын хөтөлбөрт мэрэгч амьтдыг эрэмбэлэх, хүн-зэрлэг ан амьтдын хил хязгаарт метагеномик, серологи, экологийн хяналтыг хослуулсан нэгдсэн арга барилыг хэрэгжүүлэхэд дэмжлэг үзүүлж байна.

    Ерөнхийдөө энэхүү судалгаа нь шинээр гарч ирж буй зооноз өвчний эрт үеийн сэрэмжлүүлгийн систем болон эрсдэлийн үнэлгээний хүрээг дэмжих чухал нотолгоог өгч, өндөр эрсдэлтэй бүс нутагт урьдчилан сэргийлэх тандалтын ач холбогдлыг бататгаж байна.

    Бүтээгдэхүүний мэдээлэл

    Бүтээгдэхүүний мэдээлэл1


Нийтэлсэн цаг: 2026 оны 3-р сарын 23